mtDNA Analysis Results

mtDNA Mutation Summary
		HVR1																							HVR2
Markers		1 6 1 2 6 C	1 6 2 9 4 T	1 6 5 1 9 C	1 6 3 0 4 C	1 6 2 9 6 T	1 6 1 7 2 C	1 6 2 9 2 T	1 6 1 8 9 C	1 6 3 6 2 C	1 6 1 5 3 A	1 6 2 9 7 C	1 6 1 9 2 T	1 6 2 1 8 T	1 6 2 5 7 -	1 6 0 9 3 C	1 6 1 6 9 T	1 6 1 7 9 T	1 6 1 8 7 T	1 6 2 3 9 T	1 6 2 5 6 T	1 6 2 6 6 T	1 6 2 8 7 T	Unique Mutations (+16000)	7 3 G	3 1 5 . 1 C	2 6 3 G	3 0 9 . 1 C	1 5 2 C	1 5 1 T	3 0 9 . 2 C	1 9 5 C	1 4 6 C	1 5 0 T	5 2 2 -	5 2 3 -	4 5 8 T	2 0 7 A	3 2 1 C	2 7 9 C	3 8 5 G	5 1 3 A	5 2 3 . 1 C	5 2 3 . 2 A	Unique Mutations
Freq(%) Count		100.0 130	99.2 129	97.7 127	87.7 114	67.7 88	4.6 6	4.6 6	3.8 5	3.8 5	3.1 4	3.1 4	2.3 3	2.3 3	2.3 3	1.5 2	1.5 2	1.5 2	1.5 2	1.5 2	1.5 2	1.5 2	1.5 2	0.8 1	100.0 130	100.0 130	99.2 129	73.1 95	20.8 27	9.2 12	8.5 11	7.7 10	6.9 9	6.9 9	6.2 8	6.2 8	4.6 6	3.1 4	2.3 3	1.5 2	1.5 2	1.5 2	1.5 2	1.5 2	0.8 1
ID	HG
101295	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+		+
103536	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+	+				+
103641	T2	+	+	+	+	+								+									+		+	+	+	+					+				+
105313	T2	+	+	+		+			+																+	+	+																		499A
105402	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+
107266	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+	+															+	+
114945	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+	+							+	+									573.1C, 573.2C
115061	T2	+	+	+	+																			16104T	+	+	+		+
117723	T2	+	+	+	+		+																		+	+	+	+
118313	T2	+	+	+	+																				+	+	+	+	+
119339	T2	+	+	+	+								+												+	+	+	+	+
121452	T2	+	+	+	+								+												+	+	+	+	+
122753	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+	+									+
129847	T2	+	+	+	+																				+	+	+	+	+						+	+
130057	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+	+	+
130485	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+	+
130937	T2	+	+	+	+	+									+										+	+	+	+	+				+
131805	T2	+	+	+	+					+															+	+	+	+	+																296T
133256	T2	+	+	+	+	+																		16344T	+	+	+	+	+	+
133282	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+	+				+						+
134051	T2	+	+	+							+														+	+	+	+						+
134570	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+	+
139294	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+	+		+
139350	T2	+	+	+		+			+															16182C, 16183C, 16298C	+	+	+	+			+	+
140967	T2	+	+	+	+			+																16360T	+	+	+	+	+
140981	T2	+	+	+	+																				+	+	+	+
14346	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+								+	+
143531	T2	+	+	+	+		+																		+	+	+
145122	T2	+	+	+	+							+				+									+	+	+	+
1471	T2	+	+	+	+	+																		16129A	+	+	+																		152Y, 315.2C
148620	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+	+		+
151345	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+	+				+
152722	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+	+			+	+							+						55C
153206	T2	+	+	+	+																				+	+	+	+										+
153821	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+	+
156632	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+	+
157231	T2	+	+	+	+																				+	+	+	+			+
158035	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+	+
159752	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+	+
160144	T2	+	+	+				+									+								+	+	+	+	+				+							+					189G, 194T
162809	T2	+	+	+	+																	+			+	+	+	+													+	+
163679	T2	+	+	+	+		+																		+	+	+	+
165008	T2	+	+	+	+	+				+															+	+	+	+
165528	T2	+	+	+	+	+																		16086C	+	+	+		+																338T
167168	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+																+	+
167593	T2	+	+	+	+	+																		16167T, 16261T, 16271C	+	+	+	+			+							+
169425	T2	+	+	+				+																	+	+	+	+					+	+	+	+
169886	T2	+	+								+										+				+	+	+	+						+	+	+									41T
170106	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+							+
25269	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+	+	+
28418	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+	+											+
29881	T2	+	+	+	+		+																		+	+	+	+
33563	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+	+
34386	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+	+							+	+									195N
36904	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+	+	+
40184	T2	+	+	+	+	+	+																		+	+	+																		3C
42060	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+	+									+
45485	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+	+	+
48539	T2	+	+	+	+	+									+										+	+	+		+
49737	T2	+	+	+		+			+																+	+	+		+
50845	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+	+			+
52159	T2	+	+	+	+	+																		16221T	+	+	+	+				+
52816	T2	+	+	+	+																				+	+	+	+					+				+
53314	T2	+	+	+		+																		16301T	+	+	+																		215G
54173	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+	+
54369	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+	+
54404	T2	+	+	+	+	+								+									+		+	+	+	+					+				+
55560	T2	+	+	+		+		+																	+	+	+	+					+		+	+
56471	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+		+			+
56745	T2	+	+	+	+	+																		16390A	+	+	+	+																	200G
56840	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+
6376	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+	+			+						+
64475	T2	+	+	+	+	+													+						+	+	+	+		+
64544	T2	+	+	+	+								+			+									+	+	+							+
70569	T2	+	+	+	+																				+	+	+		+
74675	T2	+	+	+	+	+						+						+						16147T	+	+	+															+
74852	T2	+	+	+	+	+									+									16291T, 16311C	+	+	+		+
75540	T2	+	+	+	+																				+	+	+	+
7774	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+	+
79685	T2	+	+	+	+																				+	+	+	+
82698	T2	+	+	+	+																			16242N	+	+	+
83004	T2	+	+	+	+																				+	+	+			+
84046	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+	+		+
87799	T2	+	+	+	+	+				+															+	+	+	+			+
89192	T2	+	+	+	+	+													+						+	+	+	+		+															195Y
94105	T2	+	+	+		+		+																	+	+	+	+							+	+
9415	T2	+	+	+	+	+								+										16259T	+	+	+	+		+
95976	T2	+	+	+	+	+																			+	+		+
96248	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+																		214G
96357	T2	+	+	+	+																				+	+	+	+
98956	T2	+	+	+	+	+																		16193T	+	+	+							+
99813	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+	+											+
99847	T2	+	+	+	+	+																		16283T	+	+	+	+
E10639	T2	+	+		+																				+	+	+	+
E11040	T2	+	+	+				+																	+	+	+		+			+	+							+
E11060	T2	+	+	+	+	+																		16241G	+	+	+	+			+
E4789	T2	+	+	+	+	+						+						+							+	+	+
E5182	T2	+	+	+	+	+														+					+	+	+
E6089	T2	+	+	+	+		+														+			16234T	+	+	+	+
E7307	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+	+		+
N10729	T2	+	+	+	+																				+	+	+	+			+
N12255	T2	+	+	+		+			+															16188T, 16278T	+	+	+	+
N12569	T2	+	+	+	+																				+	+	+	+	+
N12646	T2	+	+	+	+	+																		16257T, 16527T	+	+	+	+
N12848	T2	+	+	+		+					+	+													+	+	+	+			+			+
N15650	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+	+
N22387	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+
N2468	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+	+
N27621	T2	+	+		+	+																			+	+	+	+				+
N28285	T2	+	+	+	+																				+	+	+	+			+	+
N28747	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+							+
N3262	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+
N33343	T2	+	+	+		+					+														+	+	+	+						+
N35316	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+			+
N37951	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+	+
N41390	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+	+
N42934	T2	+		+	+																				+	+	+	+	+
N43880	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+
N51281	T2	+	+	+	+	+				+															+	+	+	+
N53423	T2	+	+	+	+																				+	+	+	+	+
N54916	T2	+	+	+	+																	+		16174T	+	+	+	+	+												+				198T
N5600	T2	+	+	+	+																				+	+	+	+
N6478	T2	+	+	+	+	+														+					+	+	+
N73833	T2	+	+	+	+																				+	+	+	+		+			+
N75446	T2	+	+	+					+																+	+	+	+
N75616	T2	+	+	+	+																			16148T, 16234Y	+	+	+	+		+
N78067	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+	+										+
N78270	T2	+	+	+		+				+														16222T	+	+	+
N82526	T2	+	+	+	+	+																			+	+	+
N9016	T2	+	+	+	+												+								+	+	+	+	+
Notes: Red Markers indicate >50% of samples tested were positive for marker * Data Entries are omitted in Genetic Distance Calculations (No HVR2 Data) * Markers are ignored in Genetic Distance Calculations + in column indicates the samples tested positive for marker blank in column indicates the samples tested negative for marker N in column indicates the samples were not tested for marker and omitted from frequency calculations HG in Bold are not estimated

Genetic Distance Report
Name	HG
101295	T2	0	3	6	4	1	4	6	2	4	2	3	3	3	4	1	2	3	4	3	4	6	2	3	9	4	3	3	3	5	4	3	3	6	4	2	2	4	2	2	9	6	4	3	2	3	7	9	11	2	1	3	4	2	5	1	3	3	1	1	2	3	4	5	4	2	2	6	7	1	4	1	4	4	5	1	5	3	3	2	3	3	3	3	4	5	6	5	3	2	3	3	3	3	4	6	4	3	2	6	3	4	6	2	4	7	2	1	2	4	5	2	1	5	2	2	2	3	1	3	2	6	3	2	5	5	6	3	4	1	3
103536	T2	3	0	5	5	2	3	5	5	3	3	4	4	2	5	2	1	4	5	4	1	5	1	2	6	5	2	4	4	4	5	2	0	3	3	1	1	3	1	1	10	5	3	2	5	4	6	8	10	3	2	2	3	1	4	2	4	2	2	4	5	2	1	4	5	1	1	5	6	2	3	2	3	3	6	4	6	6	2	1	2	4	4	2	3	4	5	4	2	3	2	4	2	2	3	7	3	4	3	5	2	3	5	3	3	6	1	2	1	1	2	3	2	4	3	1	1	4	2	2	3	7	2	3	4	4	5	2	5	2	4
103641	T2	6	5	0	8	5	6	8	8	6	6	7	7	3	8	5	4	5	8	7	6	8	4	5	11	8	5	7	7	7	8	5	5	8	6	4	4	6	4	4	11	8	6	5	8	7	9	9	13	6	5	5	6	4	7	5	7	3	5	7	8	5	6	3	8	4	4	0	7	7	6	5	4	6	9	7	9	9	5	4	5	7	7	5	6	7	8	5	5	6	5	7	5	5	6	10	6	7	6	8	5	6	8	6	6	9	4	5	4	6	7	6	5	7	6	4	4	7	5	5	6	10	5	6	5	7	8	5	8	5	7
105313	T2	4	5	8	0	3	6	8	6	6	6	7	7	5	8	5	4	7	8	7	6	6	4	5	7	8	5	5	5	7	6	5	5	8	6	4	4	6	4	4	11	8	6	5	6	5	9	9	11	4	5	5	6	4	7	5	5	5	5	5	2	5	6	7	4	4	4	8	7	5	6	3	6	6	7	5	7	7	5	4	5	5	5	5	6	7	6	7	5	4	5	5	5	5	6	8	6	5	4	8	5	6	4	6	6	7	4	3	4	6	7	4	3	5	4	4	4	7	3	5	6	10	5	4	7	3	8	5	4	3	7
105402	T2	1	2	5	3	0	3	5	3	3	3	4	4	2	5	2	1	4	5	4	3	5	1	2	8	5	2	2	2	4	3	2	2	5	3	1	1	3	1	1	10	5	3	2	3	2	6	8	10	1	2	2	3	1	4	2	2	2	2	2	3	2	3	4	3	1	1	5	6	2	3	0	3	3	4	2	4	4	2	1	2	2	2	2	3	4	5	4	2	1	2	2	2	2	3	7	3	2	1	5	2	3	5	3	3	6	1	0	1	3	4	1	0	4	1	1	1	4	0	2	3	7	2	1	4	4	5	2	3	0	4
107266	T2	4	3	6	6	3	0	6	6	4	4	5	5	3	6	3	2	5	6	5	4	6	2	3	9	6	3	5	5	5	6	3	3	6	4	2	2	4	2	2	11	6	4	3	6	1	7	9	11	4	3	3	4	2	5	3	5	3	3	5	6	3	4	5	6	2	2	6	7	5	4	3	4	4	7	5	7	7	3	2	3	5	5	3	4	5	6	5	3	4	3	5	3	3	4	10	4	5	4	6	3	4	6	4	4	7	2	3	2	4	5	4	3	5	4	2	2	5	3	3	4	8	3	4	5	5	6	3	6	3	5
114945	T2	6	5	8	8	5	6	0	8	6	6	7	7	5	4	5	4	7	8	7	6	8	4	5	11	8	5	3	7	7	8	5	5	8	6	4	4	6	4	4	13	8	6	5	8	7	9	7	9	6	5	5	6	4	3	5	7	5	5	7	8	5	6	7	8	4	4	8	5	7	6	5	6	6	9	7	9	9	5	4	5	7	7	5	6	7	4	7	5	6	5	7	5	5	6	12	6	7	6	8	5	6	8	6	6	9	4	5	4	6	7	6	5	7	6	4	4	7	5	5	6	10	5	6	7	7	8	5	8	5	7
115061	T2	2	5	8	6	3	6	8	0	4	2	3	3	5	4	3	4	5	4	5	6	6	4	5	11	4	3	5	3	5	6	5	5	8	4	4	4	4	4	4	9	6	4	5	4	5	9	9	11	4	3	5	4	4	7	3	5	5	3	3	4	5	6	5	6	4	4	8	9	3	6	3	6	6	5	1	7	5	3	4	3	3	3	5	6	7	8	7	5	4	3	5	5	5	4	6	6	5	4	6	5	4	8	2	6	9	4	3	4	6	5	4	3	7	4	4	4	3	3	5	2	6	3	4	5	5	6	5	6	3	3
117723	T2	4	3	6	6	3	4	6	4	0	2	3	3	3	4	3	2	5	4	5	4	4	2	3	9	4	1	5	1	3	6	3	3	6	2	2	2	2	2	2	9	4	0	3	6	5	7	7	9	4	3	3	0	2	5	3	3	3	3	5	6	3	4	3	6	2	2	6	7	5	4	3	4	4	5	3	7	7	1	2	1	3	3	3	4	5	6	5	3	4	1	5	3	3	2	8	4	5	4	2	3	2	6	2	4	7	2	3	2	4	3	4	3	5	4	2	2	3	3	3	2	6	1	4	3	3	4	3	6	3	3
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Genetic Distance

> 3

A lower number in a column indicates a closer match

Created with mtDNAtool version 0.65 BETA.

mtDNA Mutation Summary

Genetic Distance Report