mtDNA Analysis Results

mtDNA Mutation Summary
		HVR1																												HVR2
Markers		1 6 1 2 6 C	1 6 2 9 4 T	1 6 3 0 4 C	1 6 2 9 6 T	1 6 5 1 9 C	1 6 5 1 9 C	1 6 1 7 2 C	1 6 0 9 3 C	1 6 1 0 4 T	1 6 1 8 9 C	1 6 2 5 7 -	1 6 1 9 2 T	1 6 2 6 1 T	1 6 2 9 7 C	1 6 3 6 2 C	1 6 1 8 7 T	1 6 2 6 6 T	1 6 1 5 3 A	1 6 1 7 4 T	1 6 2 1 8 T	1 6 2 2 1 T	1 6 2 3 9 T	1 6 2 5 6 T	1 6 2 7 8 T	1 6 2 9 2 T	1 6 3 1 1 C	1 6 3 6 8 C	Unique Mutations (+16000)	7 3 G	3 1 5 . 1 C	2 6 3 G	3 0 9 . 1 C	1 5 2 C	1 5 1 T	1 9 5 C	3 0 9 . 2 C	1 4 6 C	4 5 8 T	1 5 0 T	5 2 2 -	5 2 3 -	2 0 7 A	3 2 1 C	3 8 5 G	5 1 3 A	Unique Mutations
Freq(%) Count		100.0 175	99.4 174	95.4 167	72.6 127	61.7 108	37.7 66	5.1 9	4.0 7	2.9 5	2.9 5	2.9 5	2.3 4	2.3 4	2.3 4	2.3 4	1.7 3	1.7 3	1.1 2	1.1 2	1.1 2	1.1 2	1.1 2	1.1 2	1.1 2	1.1 2	1.1 2	1.1 2	0.6 1	62.9 110	62.9 110	61.7 108	46.9 82	13.1 23	6.9 12	5.7 10	4.6 8	3.4 6	3.4 6	2.3 4	2.3 4	2.3 4	1.7 3	1.7 3	1.1 2	1.1 2	0.6 1
ID	HG
103536	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+	+			+
103641	T2	+	+	+	+	+															+								16287T	+	+	+	+					+	+
105313	T2	+	+		+	+					+																			+	+	+															499A
105402	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+
106837	T2	+	+	+	+		+
107266	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+	+														523.1C, 523.2A
108336	T2	+	+	+			+		+						+
109434	T2	+	+	+			+	+						+
112552	T2	+	+	+	+	+																							16263Y	+	+	+	+			+
114988	T2	+	+	+	+		+									+									+
115061	T2	+	+	+		+				+																				+	+	+		+
116148	T2	+	+	+			+			+
116155	T2	+	+	+	+		+																					+
117723	T2	+	+	+		+		+																						+	+	+	+
118313	T2	+	+	+		+																								+	+	+	+	+
119339	T2	+	+	+		+							+																	+	+	+	+	+
120866	T2	+	+	+	+		+
121115	T2	+	+	+	+		+
121452	T2	+	+	+		+							+																	+	+	+	+	+
122753	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+	+						+
124628	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+	+								+	+					228A
125585	T2	+	+	+			+	+
126657	T2	+	+	+	+		+
128942	T2	+	+	+	+		+																+	+					16289G
129847	T2	+	+	+		+																								+	+	+	+	+							+	+
130057	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+	+	+
130485	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+	+
130937	T2	+	+	+	+	+						+																		+	+	+	+	+				+
131805	T2	+	+	+		+										+														+	+	+	+	+													296T
133256	T2	+	+	+	+	+																							16344T	+	+	+	+	+	+
133282	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+	+			+							+
133679	T2	+	+	+			+			+
134916	T2	+	+	+	+		+
136628	T2	+	+	+	+		+
139294	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+	+		+
139350	T2	+	+		+	+					+																		16182C, 16183C, 16298C	+	+	+	+			+	+
140967	T2	+	+	+		+																				+			16360T	+	+	+	+	+
140981	T2	+	+	+		+																								+	+	+	+
142489	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+
14346	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+									+	+
143531	T2	+	+	+		+		+																						+	+	+
144183	T2	+	+	+	+		+
145122	T2	+	+	+		+			+						+															+	+	+	+
1471	T2	+	+	+	+	+																							16129A	+	+	+															152Y, 315.2C
148620	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+	+		+
151345	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+	+			+
152722	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+	+			+	+							+			55C
153206	T2	+	+	+		+																								+	+	+	+										+
153821	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+	+
154012	T2	+	+	+	+		+
154798	T2	+	+		+		+												+
155069	T2	+	+	+			+
155540	T2	+	+	+	+		+																						16527T
155989	T2	+	+	+	+		+							+
156625	T2	+	+	+	+		+																						16524G
156632	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+	+
156812	T2	+	+	+	+		+
157231	T2	+	+	+			+
157273	T2	+	+	+	+		+
157507	T2	+	+	+			+		+				+
158035	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+	+
159752	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+	+
160033	T2	+	+	+	+		+
162809	T2	+	+	+		+												+												+	+	+	+												+	+
25269	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+	+	+
27199	T2	+	+	+	+		+										+
27652	T2	+	+	+		+		+																						+	+	+	+
28418	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+	+											+
29881	T2	+	+	+		+		+																						+	+	+	+
3228	T2	+	+	+	+		+
34386	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+	+								+	+					195N
36904	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+	+	+
40184	T2	+	+	+	+	+		+																						+	+	+															3C
42060	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+	+						+
45485	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+	+	+
47767	T2	+	+	+	+		+
48539	T2	+	+	+	+	+						+																		+	+	+		+
49742	T2	+	+	+	+		+
49789	T2	+	+	+	+		+																						16271C, 16293G
50283	T2	+	+	+	+		+							+
50845	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+	+				+
52159	T2	+	+	+	+	+																+								+	+	+	+			+
52816	T2	+	+	+		+																								+	+	+	+					+	+
53314	T2	+	+		+	+																							16301T	+	+	+															215G
54173	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+	+
54369	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+	+
56471	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+		+		+
56745	T2	+	+	+	+	+																							16390A	+	+	+	+														200G
56840	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+
6376	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+	+				+		+
64238	T2	+	+	+	+		+
64475	T2	+	+	+	+	+											+													+	+	+	+		+
64544	T2	+	+	+		+			+				+																	+	+	+								+
68605	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+						+	+
68706	T2	+	+	+			+			+
72933	T2	+	+	+			+							+
74059	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+
74675	T2	+	+	+	+	+									+														16147T, 16179T	+	+	+														+
74852	T2	+	+	+	+	+						+															+		16291T	+	+	+		+
75540	T2	+	+	+		+																								+	+	+	+
76498	T2	+	+	+	+		+															+
77348	T2	+	+	+	+		+																						16111T
7774	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+	+
79685	T2	+	+	+		+																								+	+	+	+
81783	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+
82698	T2	+	+	+		+																							16242N	+	+	+
83004	T2	+	+	+		+																								+	+	+			+
84046	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+	+		+
84537	T2	+	+	+	+	+																								+	+		+
85350	T2	+	+	+	+		+																						16292N
86603	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+	+														189G
87799	T2	+	+	+	+	+										+														+	+	+	+				+
89192	T2	+	+	+	+	+											+													+	+	+	+		+												195Y
91574	T2	+	+	+	+		+
92419	T2	+	+	+	+		+
94105	T2	+	+		+		+																			+
9415	T2	+	+	+	+	+															+								16259T	+	+	+	+		+
95976	T2	+	+	+	+	+																								+	+		+
96248	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+															214G
96357	T2	+	+	+		+																								+	+	+	+
98956	T2	+	+	+	+	+																							16193T	+	+	+								+
99813	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+	+											+
99847	T2	+	+	+	+	+																							16283T	+	+	+	+
E5182	T2	+	+	+	+	+																	+							+	+	+
E6089	T2	+	+	+		+		+																+					16234T	+	+	+	+
E7307	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+	+		+
N10729	T2	+	+	+		+																								+	+	+	+				+
N12255	T2	+	+		+	+					+														+				16188T	+	+	+	+
N12569	T2	+	+	+		+																								+	+	+	+	+
N12646	T2	+	+	+	+		+																						16257T, 16527T	+	+	+	+
N12848	T2	+	+		+	+									+				+											+	+	+	+				+			+
N13000	T2	+	+	+	+		+
N15835	T2	+	+	+	+		+
N20186	T2	+	+	+	+		+																						16365T
N22387	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+
N2468	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+	+
N25822	T2	+	+	+	+		+
N27236	T2	+	+	+	+		+
N27621	T2	+	+		+																								16304C	+	+	+	+			+
N28285	T2	+	+	+		+																								+	+	+	+			+	+
N28747	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+								+
N30247	T2	+	+	+	+		+
N3262	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+
N35311	T2	+	+	+	+		+
N35316	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+			+
N35492	T2	+	+	+	+		+																					+
N37951	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+	+
N41036	T2	+	+	+	+		+		+			+
N41390	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+	+
N41701	T2	+	+	+			+											+		+
N42934	T2	+		+		+																								+	+	+	+	+
N46107	T2	+	+	+	+		+				+
N49536	T2	+	+	+	+	+						+																		+	+	+		+				+
N49913	T2	+	+	+			+		+	+																			16305G
N51281	T2	+	+	+	+	+										+														+	+	+	+
N51999	T2	+	+	+			+	+
N53423	T2	+	+	+		+																								+	+	+	+	+
N53602	T2	+	+	+	+		+																				+
N54916	T2	+	+	+		+												+		+										+	+	+	+	+											+		198T
N56756	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+	+
N61790	T2	+	+	+		+					+																			+	+	+	+	+
N67080	T2	+	+	+			+
N69094	T2	+	+	+	+		+
N70955	T2	+	+	+	+		+
N72119	T2	+	+	+	+		+
N73152	T2	+	+	+	+		+																						16178C
N73605	T2	+	+	+			+
N73833	T2	+	+	+		+																								+	+	+	+		+			+
N74673	T2	+	+	+	+		+		+
N75616	T2	+	+	+		+																							16148T, 16234Y	+	+	+	+		+
N78067	T2	+	+	+	+	+																								+	+	+	+										+
N78635	T2	+	+	+	+		+
N79085	T2	+	+	+	+		+
N79435	T2	+	+	+	+		+																						16243C
N9016	T2	+	+	+		+																							16169T	+	+	+	+	+
Notes: Red Markers indicate >50% of samples tested were positive for marker * Data Entries are omitted in Genetic Distance Calculations (No HVR2 Data) * Markers are ignored in Genetic Distance Calculations + in column indicates the samples tested positive for marker blank in column indicates the samples tested negative for marker N in column indicates the samples were not tested for marker and omitted from frequency calculations HG in Bold are not estimated

Genetic Distance Report
Name	HG
103536	T2	0	5	5	2	7	3	10	10	1	9	5	9	8	3	3	4	7	7	4	2	4	9	7	10	5	2	1	4	5	4	1	9	7	7	2	6	5	2	2	4	4	7	4	5	2	0	3	3	1	7	9	8	8	8	8	1	7	8	7	10	1	1	7	5	2	8	3	2	3	7	4	2	4	2	2	7	4	7	9	8	2	1	4	5	1	1	2	3	2	3	7	3	6	4	9	9	2	6	6	2	8	8	1	2	2	4	4	2	2	8	2	3	4	7	7	9	4	2	3	2	4	2	2	3	5	2	3	5	3	5	6	7	7	8	2	1	7	7	3	2	3	7	2	7	3	8	1	9	1	10	4	8	5	11	2	9	3	8	7	1	4	8	7	7	7	8	8	4	8	5	2	7	7	8	4
103641	T2	5	0	8	5	10	6	13	13	6	12	8	12	11	6	6	7	10	10	7	3	7	12	10	13	8	5	4	5	8	7	6	12	10	10	5	11	8	5	5	7	7	10	7	8	5	5	8	6	4	10	12	11	11	11	11	4	10	11	10	13	4	4	10	8	5	11	6	5	6	10	7	5	7	3	5	10	7	10	12	11	5	6	3	8	4	4	7	6	5	4	10	6	9	3	12	12	5	9	9	5	11	11	4	5	5	7	7	5	5	11	5	6	7	10	10	12	5	5	6	5	7	5	5	6	8	5	6	8	6	8	9	10	10	11	5	4	10	10	8	7	6	10	5	10	6	11	4	12	4	13	7	11	6	14	5	12	6	11	10	4	7	11	10	10	10	11	11	5	11	8	5	10	10	11	7
105313	T2	5	8	0	3	8	6	11	11	6	10	6	10	9	6	6	7	8	8	7	5	7	10	8	11	8	5	4	7	8	7	6	10	8	8	5	7	8	5	3	5	5	8	7	6	5	5	8	6	4	8	8	9	9	9	9	4	8	9	8	11	4	4	8	8	5	9	6	5	6	8	7	5	5	5	5	8	5	8	10	9	5	6	7	4	4	4	5	6	3	6	8	6	7	5	10	10	3	7	7	5	9	9	4	5	3	5	5	5	5	9	5	6	7	8	8	8	7	5	4	5	5	5	5	4	8	5	6	4	6	8	7	8	8	9	3	4	8	8	6	7	4	8	3	8	4	9	4	10	4	11	7	7	6	12	5	10	6	9	10	4	5	9	8	8	8	9	9	7	9	8	5	8	8	9	7
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mtDNA Mutation Summary

Genetic Distance Report